Любые загрузки и перегрузки данных предварительно настраиваются, работа настроек проверяется, настройки сохраняются. Только после этого можно выполнять реальную загрузку данных и генерацию документов. 
Обработка входящих и исходящих платежей происходит отдельно:
Особенности заполнения настройки бухгалтерской операции для авансов от покупателей:
По предоплатам от покупателя для генерации документа Приход денег на счет должна применяться бухгалтерская операция со ставкой НДС типа 21/121% - в этом случае сумма НДС будет вычислена методом обратного пересчета от суммы, зачисленной на счет. Если использовать ставку типа 21%, то на сумму банковского прихода будет добавлена поверх сумма НДС.
В конфигурации автоматизированная система учета предоплат (получение авансов, автозачет НДС и последующее погашение предоплат) базируется на том, что:
Другие варианты учета предоплат не поддерживаются и результаты по ним не комментируются, но могут быть реализованы пользователем самостоятельно полностью под его ответственность.